Allisa Clinical Informatics Platform
Alissa Align & Call je modul pro analýzu dat na platformě Alissa Clinical Informatics, který analyzuje surová NGS data pomocí patentovaných algoritmů optimalizovaných pro knihovny a reagencie řad Agilent SureSelect, HaloPlex a OneSeq. Vysoce kvalitní mapování Align & Call umožňuje škálovatelné přiřazování nalezených variant pro detekci, anotaci a vizualizaci.
Posouzení QC u Align & Call a generování souborů VCF integruje pracovní postup analýz s následným vyhodnocením dat a reportováním Alissa Interpret *a snižuje tak složitost a šetří drahocenný čas při práci s NGS daty - od surových dat po návrh reportu.
- Optimalizované algoritmy pro analýzu SNPs/ indelů, CNV a cnLOH
- Vizualizace variant v rozhraní genomového prohlížeče podporující zobrazení vlastních a výchozích tracků
- Anotace a vyloučení variant ve výsledcích analýzy
- Vytváří soubory hodnocení QC, které zajišťují důvěryhodnost výsledků testu
- Bezproblémová integrace a navigace s modulem interpretace dat, Alissa Interpret, pokud je k dispozici licencovaný účet
- Sdílený přístup ke všem ukázkovým souborům a výsledkům pro všechny uživatele v rámci stejné pracovní skupiny
- Přiřazení specifických uživatelských rolí spravovaných správcem pracovní skupiny, která definují povolená oprávnění uživatele pro každý účet
- Prostředí certifikované ISO 27001
Agilent Alissa Batch Uploader
Softwarová aplikace Agilent Alissa Batch Uploader je desktopový nástroj pro ruční nebo automatické nahrávání souborů (aligned nebo unaligned) a sledování souborů ze serveru vašeho sekvenátoru nebo složky sdíleného úložiště do pracovní skupiny Alissa Align & Call. Po dokončení nahrávání jsou soubory k dispozici pro analýzu v programu Alissa Align & Call a "track" soubory jsou k dispozici pro import do databáze Alissa Align & Call tracks.
Aplikace je ke stažení na stránkách Agilent Technologies zde.
Pouze pro výzkumné účely. Není určeno pro diagnostické účely.
*Alissa Interpret je kompatibilní se všemi nástroji pro sekundární analýzu dat, které produkují běžné VCF soubory.
Pro více informací nás kontaktujte na dgg@hpst.cz.
