​​SureSelect Cancer CGP Assay

SureSelect Cancer CGP nabízí komplexní genomové profilování pro solidní nádory. Tento panel pan-cancer NGS umožňuje detekci somatických variant, včetně jednonukleotidových variant (SNV), variant počtu kopií (CNV), inzercí/delecí (indel), translokací (TL), genových fúzí a imuno-onkologických biomarkerů TMB (tumor mutational burden) a MSI (microsatellite instability).

Pro přípravu knihovny se používá SureSelect XT HS2 a chemie target enrichment, což se vyznačuje rychlou hybridizací, nízkým vstupním množstvím vzorku, enzymatickou fragmentací a jednodenním pracovním postupem pro vytvoření knihoven připravených pro sekvenování NGS. Možnosti automatizace zkracují čas nutný k přípravě a maximalizují efektivitu laboratoře.
Pouze pro výzkumné použití. Není určeno pro diagnostické postupy.

Využití chemie SureSelect XT HS2 pro SureSelect Cancer CGP

Vlastnosti

• Globálně vybraný soubor genů (679 genů pro DNA, 80 genů pro RNA) pocházející z databází rakoviny a od předních klinických vědců na poli výzkumu rakoviny.
• Vylepšená efektivita laboratorní práce díky možnosti automatizace, včetně systému Agilent Magnis NGS Prep, který vyžaduje minimální odborné znalosti a pouze 15 minut vašeho pracovního času, a pracovní stanice Agilent Bravo NGS, platforma pro manipulaci s kapalinami pro zpracování až 96 vzorků na běh.
• Možnost využití enzymatické fragmentace eliminuje potřebu zařízení pro mechanickou fragmentaci.
• Začněte s minimálním vstupním množstvím 10 ng DNA (doporučeno 50 ng), aby bylo možné profilovat více vzorků
• Rychlá hybridizace (90 minut) umožňuje přípravu knihovny za jediný den
• Detekce de novo genových fúzí (80 genů) vyžadujících pouze jednoho genového partnera
• Vyvinuto pro více typů vzorků včetně FFPE
• Modulární pracovní postup umožňuje možnost testovat DNA a RNA samostatně nebo společně ve stejném sekvenačním běhu
• Integrovaná analýza dat díky platformě Agilent Alissa Clinical Informatics. Také kompatibilní s interními informatickými přístupy uživatele a analytickým softwarem třetí strany

* Kompatibilní s automatickou pracovní stanicí Agilent Bravo NGS