Současná detekce SNV, CNV a translokací v nádoru pomocí SureSelect Cancer All-In-One
Firma Agilent Technologies letos na jaře představila inovativní systém pro tvorbu a analýzu sekvenačních knihoven, SureSelect Cancer All-In-One, založený na technologii “hybridiation-based target enrichement”. Knihovny Cancer All-In-One umožňují současnou detekci somatických SNV, indel mutací a CNV či translokací s rozlišením na jednotlivé geny. Celý systém je zaměřen na citlivou detekci variant v klonální nádorové frakci vzorku s možností využití přilehlé zdravé tkáně jako reference.
V současnosti jsou na výběr dva fixní panely: SureSelect Cancer All-In-One Lung Assay a SureSelect Cancer All-In-One Solid Tumor Assay. Zákazníci mají také možnost tvorby vlastního panelu pomocí jednoduchého webového rozhraní SureDesign, kde si mohou určit v kterých genech chtějí jednotlivé typy variant detekovat.
Technologie cíleného obohacení SureSelect umožňuje použití nízkých vstupních koncentrací DNA a tvorbu finální knihovny během jediného dne. Nová verze analyzačního nástroje SureCall 4.1 umožnňuje robustní a přesnou detekci všech typů variant a je zdarma součástí systému SureSelect Cancer All-In-One.