Registrace z důvodu vyčerpání kapacity obou termínů je UKONČENA.
Kurz je určen pro pracovníky výzkumných a diagnostických laboratoří, kteří si chtějí prohloubit základní znalosti v genomice a analýze sekvenačních dat.
Jednodenní kurz vám pomůže zorientovat se v základech bioinformatické analýzy a naučí vás účelně využívat dostupné genomické databáze jako NCBI a UCSC. Dále vám přiblíží základní principy jednotlivých sekvenačních technik a poodhalí význam nejčastěji používaných formátů genomických dat (FASTA, FASTQ, SAM/BAM, VCF, BED ...). Kurz probíhá v malém kolektivu a je možné diskutovat libovolná témata týkající se genomiky a NGS. Náplň je orientovaná především na lidskou genomiku.
Kurz proběhne ve dvou termínech: 23. 11. 2022 a 30. 11. 2022.
Vždy v čase 9:00 - 17:00.
V případě zájmu se kurzu zúčastnit, vyberte si termín v rámci registračního formuláře.
Délka školení: 1 den
Místo: ve školící místnosti HPST, s.r.o., Na Jetelce 69/2, Praha 9 (v blízkosti Nádraží Vysočany) - mapa
Cena: na vyžádání
Počet osob: 8
Pro více informací: Mgr. Tomáš Hron, Ph.D., tel. 605 325 350 nebo piště na e-mail tomas.hron@hpst.cz
Program: Probírány budou základy běžných genomických analýz a principy sekvenace nové generace. Dále si vyzkoušíte práci s genomickými databázemi a nástroji, které vám umožní získat potřebná data (UCSC genome browser, UCSC table browser, Ensembl Variant Effect Predictor). V neposlední řadě vám budou také stručně představeny možnosti pro pokročilejší práci s genomickými daty (Galaxy, MySQL aj.). Náplň kurzu se pokusíme maximálně přizpůsobit vašim potřebám.
Teoretická část:
- Princip sekvenačních technologií
- Základy analýzy NGS dat
- Struktura genomických databází
Praktická část
- Práce s genomickými daty
- UCSC Genome Browser / NCBI
- Užitečné genomické nástroje (BLAST/BLAT, Ensembl Variant Effect Predictor… )
V případě dalších dotazů neváhejte kontaktovat školitele kurzu.
