SureDesign
SureDesign je bezplatná webová aplikace, která Vám umožní plně využít flexibility SurePrint technologie od Agilent Technologies při navrhování microarrays, FISH prób nebo NGS cílených knihoven (TE - target enrichment), které budou odpovídat plně Vašim požadavkům a cílit na oblasti Vašeho zájmu.
Pozor, nová verze 5.0.1 !!!
Nová aktualizace SureDesign v. 5.0.1 podporuje nejnovější lidské genomy "hg38" a "hg19". Všechny nové katalogové knihovny počínaje SureSelect Human All Exon V7 budou anotovány pro oba genomy a vy si můžete vybrat, který design použijete. Již existující katalogové knihovny budou dále k dispozici s anotací pouze pro genom hg19. Při tvorbě nových zákaznických designů si také můžete vybrat, zda budou vytvořeny vůči genomu hg38 a hg19. Nelze ale tyto dva genomy při tvorbě designu kombinovat.
Další změny: Podpora nově vydaného designu SureSelect Custom Constituonal Panel 17 Mb, nových katalogových designů CRISPRa, CRISPRi a OneSeq.
CGH, ChIP-on-chip a DNA metylace
- navrhněte si vlastní miroarray design pro CGH, ChIP-on-chip nebo studium DNA metylací
- vyberte si formát od 8 x 15K až po 1 x 1M
NGS Target Enrichment
- vytvořte si vlastní design pro SureSelect nebo HaloPlex TE s cíleným zaměřením na oblasti, které chcete sekvenovat
CRISPR Guide RNAs
- najděte gRNAs, které odpovídají místům CRISPR
- identifikujte potenciální kandidátní oblasti
- stáhněte si připravené DNA templátové sekvence
FISH próby
- vložte názvy genů, IDs nebo genomické koordináty a vytvořte vlastní "break apart", "dual fusion" nebo "single" próby
