Nové microarray Agilent SurePrint HT CGH ve třech formátech pro zákaznický design microarray (16x CGH, 16x CGH+SNP a 24x CGH), přináši další možnosti analýzy microarrays vybraných genomických oblastí. Nové formáty microarry SurePrint HT CGH arrays nabízejí unikátní kombinaci vysoké produktivity, obsahu a ceny, čímž zaplňují mezeru mezi multiplexním PCR (množství dat) a NGS/microarray (drahé/komplexní). Sklíčka byla optimalizovaná tak, aby se dosáhlo výborné rovnováhy mezi on-slide multipexováním a obsahem, aby byla dosažena maximální míra flexibility zákaznických designů. Díky tomu umožňují cílenou analýzu vybraných oblastí u velkého počtu vzorků v krátké čase a za nižší náklady. Tyto arrays jsou k dispozici pro komparativní genomovou hybridizaci (16x a 24x CGH) a ztrátu heterozygosity (16x CGH+SNP).
Výhodou nových Agilent SurePrint HT CGH array je kromě nových formátů také zjednodušený pracovní postup. Pro tento typ microarray můžete použíat stávající hardware a software, na který jste zvyklí.
Obsah array můžete snadno definovat na základě online databáze prob . Pokryjte celý genom ve vysokém rozlišení, vyberte podmnožinu prob z katalogu designů Agilent, nebo přidejte nově objevené, sekvenované oblasti genomu a to vše v několika snadných krocích.
Přehled SurePrint HT CGH arrays
| G4133A | SurePrint G3 Custom HT Microarray CGH 24x13k |
| G4132A | SurePrint G3 Custom HT Microarray CGH 16x25K |
| G4132B | SurePrint G3 Custom HT Microarray CGH+SNP 16x25K |
Přehled důležitých vlastnostií
- Zjednodušený pracovní postup
- Menší vstupní množství gDNA
- Menší objemy reagencií
Pracovní postup
SureTag HT Complete DNA Labelling kit (kat. č. G9978A)
- Kompletní sada pro značení DNA s kuličkami SurePure Beads.
- Nová sada Agilent SureTag HT nabízí vylepšenou a zjednodušenou purifikaci pomocí patentovaných nanokuliček od společnosti Agilent a nevyžaduje žádný krok speed-vacuum, což umožňuje efektivní zpracování a přizpůsobení požadavkům na objem.
- Rychlejší zpracování při použití více vzorků.
- Umožňuje pracovat s mikrotitračními destičkami, zkumavkami ve stripu a mikrozkumavkami.
- Snížené náklady na sadu zároveň vedou k celkově nižší ceně za vzorek
Agilent HybStation Platform (kat. č. G5765A)
Zpracujte své vzorky snadno a dosáhněte reprodukovatelných výsledků a zároveň snižte nároky na školení s Agilent HybStation, novou platformou pro nanášení vzorků na sklíčka, která poskytuje konzistentní a bezstresový proces přípravy mikroarrayí.
SureDesign
Je online nástroj, který umožňuje návrh vlastních CGH, CGH+SNP a DNA arrayí pomocí snadného průvodce. Zadejte svou oblast zájmu, název genu, chromozomální umístění nebo svůj soubor fasta a vyberte si z databáze více než 29 milionů sond.
Feature Extraction (FE)
Software FE čte a zpracovává až 100 raw snímků z microarrayí v automatizovaném režimu. Zpracovává obrázky, normalizuje data a vypočítává různé parametry pro měření statistické spolehlivosti. Kromě toho FE generuje zprávy QC specifické pro aplikaci, které shrnují více analýz.
CytoGenomics 5.3
Software Agilent CytoGenomics poskytuje pokročilé nástroje pro analýzu dat pro cytogenetiky. Systém nabízí zjednodušený pracovní postup od nahrání dat až po závěrečnou zprávu. Tento multianalytický software je navržen speciálně pro cytogenetický výzkum, aby získaná data dostala biologický kontext. Intuitivní pracovní postup cytogenetické analýzy dokáže přesně detekovat změny počtu kopií a variace neutrální na počtu kopií, včetně LOH a UPD.